潜艇是游戏二战风云2中一种隐蔽性强、突袭能力突出的独特海军兵种，其核心玩法与水面舰船截然不同，主要围绕伏击和奇袭展开。这种舰船不适合进行正面硬刚的阵地战，它的核心优势在于其伏击技能，可以在水下潜行以避免敌方侦察，并在敌方目标进入攻击范围后发动出其不意的致命攻击。潜艇的战术定位是以隐蔽和突袭为主，优先攻击孤立或高价值的水面目标，以此在战局中创造出其不意的战术优势。在游戏的某些特定模式下，早期优先发展潜艇部队甚至被视作一种有效的开局策略，能够对敌人形成有效威慑。
要有效运用潜艇，玩家必须熟练掌握其操作技巧与技能搭配。潜艇在水下的移动速度相对较慢，且潜航会持续消耗有限的氧气，因此需要玩家提前规划好航行路线，并注意适时上浮补充空气，同时要考虑到其鱼雷攻击后较长的装填时间，规划好一击即走的攻击节奏。在技能组合上，推荐以伏击、声呐和鱼雷为核心，伏击技能是实现隐蔽突袭的根本，声呐技能可以扩大侦察范围以提前掌握敌方动向，而鱼雷技能则是其主要输出手段。装备选择上，应优先考虑提升潜艇的隐蔽性能和鱼雷攻击伤害，确保其能在短暂的接敌窗口内造成最大杀伤。
潜艇的主要职责是猎杀敌方高价值的大型水面舰艇，尤其是战列舰和航空母舰，它被普遍认为是克制战列舰的最有效手段之一，因为其水下特性可以规避战列舰强大的主炮火力。除了对抗主力舰队，潜艇也能有效执行诸如打击敌方运输船、清除海盗等多样化任务，从而在战略层面切断敌方补给线或获取额外资源。由于其强大的突袭能力，一支成规模的潜艇部队在战场上往往能够形成巨大的心理威慑，迫使敌方投入更多资源进行反制。在多舰协同作战时，多艘潜艇可以尝试采用类似狼群的战术，对同一支敌方舰队进行协同伏击，以大幅提高攻击效率。
潜艇的强势也伴明显的弱点和风险，玩家需要清晰地认识到其局限性。潜艇的防御能力十分脆弱，一旦被敌方发现并锁定，很容易在集火攻击下迅速损失。装备了声呐和深水炸弹的驱逐舰是潜艇的天敌，能够有效探测和攻击水下目标，因此潜艇在行动时应极力避免进入敌方驱逐舰的巡逻范围，或在遭遇时选择绕道而行。在团队作战体系中，潜艇更适合作为辅助与奇袭单位，与主力舰队进行配合，例如由潜艇先行侦察并提供敌方舰队位置信息，引导己方战列舰进行远程打击，或与己方驱逐舰协同，由驱逐舰负责反潜护航，潜艇则专注偷袭。
在游戏初期，于特定模式下优先建造潜艇可以快速建立战术优势。到了游戏中后期，当玩家建立起优势后，也应当考虑投入资源建造一定数量的潜艇用于舰队防守，以防范敌方可能发动的渗透和偷袭。掌握潜艇的玩法需要玩家具备良好的战术意识、耐心以及对战场节奏的把控能力，它并非一种可以无脑推进的兵种，但若运用得当，将成为决定海战胜负的关键力量。
